Un Comité de Pilotage partenarial a été crée, composé des représentants de la Région, de l'Etat (DREAL) et des 5 Conseils Généraux.
Il définit les modalités et le calendrier de travail de l'Observatoire, puis assure un suivi régulier de sa mise en œuvre.

Un Groupe de Travail "Inondation" a été constitué, associant les principaux acteurs de la prévention du risque inondation. Ces derniers sont désignés par le Comité de pilotage en raison de leurs qualifications et de leurs compétences particulières. Ils ont un rôle de conseil et de proposition auprès du Comité de pilotage.